Internal coordinates

Methane: 

C  
H     1    B1
H     1    B2   2    A1
H     1    B3   2    A2   3    D1
H     1    B4   2    A3   3    D2

B1  1.090000358
B2  1.090000358
B3  1.090000358
B4  1.090000358
A1  109.4712206
A2  109.4712206
A3  109.4712206
D1 -120.0000000
D2  120.0000000
 

Ethane: 

C  
C     1    B1
H     2    B2   1    A1
H     2    B3   1    A2   3    D1
H     2    B4   1    A3   3    D2
H     1    B5   2    A4   3    D3
H     1    B6   2    A5   3    D4
H     1    B7   2    A6   3    D5

B1  1.540000000
B2  1.090000000
B3  1.090000000
B4  1.090000000
B5  1.090000000
B6  1.090000000
B7  1.090000000
A1  109.4712206
A2  109.4712206
A3  109.4712206
A4  109.4712206
A5  109.4712206
A6  109.4712206
D1  120.0000000
D2 -120.0000000
D3  180.0000000
D4 -60.00000000
D5  60.00000000
 

Phosphorus pentachloride: 

P  
Cl    1    B1
Cl    1    B2   2    A1
Cl    1    B3   2    A2   3    D1
Cl    1    B4   2    A3   3    D2
Cl    1    B5   2    A4   3    D3

B1  2.194133000
B2  2.318426000
B3  2.318426000
B4  2.194132822
B5  2.194132822
A1  90.00000000
A2  90.00000000
A3  119.9999876
A4  119.9999876
D1  180.0000000
D2 -90.00000000
D3  90.00000000
 

trans-1,2-Dichloroethene: 

C  
C     1    B1
Cl    2    B2   1    A1
H     2    B3   1    A2   3    D1
Cl    1    B4   2    A3   3    D2
H     1    B5   2    A4   3    D3

B1  1.309000498
B2  1.759999898
B3  1.090000139
B4  1.759999898
B5  1.090000139
A1  119.9999814
A2  119.9999753
A3  119.9999814
A4  119.9999753
D1  180.0000000
D2  180.0000000
D3  0.000000000
 

Formaldehyde: 

C  
O     1    B1
H     1    B2   2    A1
H     1    B3   2    A2   3    D1

B1  1.184263000
B2  1.091631076
B3  1.091631076
A1  122.1630209
A2  122.1630209
D1  180.0000000