Gamess

Gamess

安裝流程：

  1. Verify that the gnu f77 (g77) compiler has been installed on the Linux workstation:
    % rpm -qa | grep gcc-g77
    ( 檢查是否有安裝 gcc-g77 套件，沒有安裝的話，請自行安裝。此套件放在 Redhat 9.0 安裝光碟的第二片光碟中。 除此之外，也需要 libf2c 的套件。在同一張光碟中。)

  1. Uncompress the archive
    % su
    # cd /usr/local
    # tar xzvf /{download_dir}/gamess-current.tar.tar
    # chown -R root:root gamess ( or chown -R root:users gamess )
    ( 用 superuser 登入，切換到 /usr/local 的目錄下，並將 Gamess-current.tar.tar 解壓縮至此，並把Gamess資料夾的 owener 及 group 改為 root ，但建議把 group 改為 users 比較好。否則可能在之後的測試中會出現執行的權限不足的情況發生。)

  1. Update the four scripts: comp, compall, lked, runall
    # cd /usr/local/gamess
    # vi {scriptname}
    Change the line
          chdir /u1/mike/gamess
    to
          chdir /usr/local/gamess
    and (except in 'runall' script, where no reference exists)
          set TARGET=ibm
    to
          set TARGET=linux-pc
    ( 在 gamess 的目錄下，用 vi 編輯 comp, compal, lked, runall 這四個檔，把 chdir/u1/mike/gamess 改為 chdir /usr/local/gamess 及 set TARGET = ibm 改為 set TARGET = linux-pc。)

  1. Update the following script: rungms
    # vi rungms
    Edit the following lines to read as follows
          set TARGET=sockets
    and
          set SCR=/tmp
    and in newer versions of gamess
          setenv ERICFMT /usr/local/gamess/ericfmt.dat and setenv MCPPATH /usr/local/gamess/mcpdata
    and later in the file
          if ($os == Linux) set GMSPATH=/usr/local/gamess
    ( 類似上一步驟，用 vi 編輯 rungms 這個檔案，將原本的 SCR 的路徑改為 SCR=/twp，set ERICFMT 的部份改為 /usr/local/gamess/ericfmt.dat，set MCPPATH的路徑，改為 /usr/local/gamess/mcpdata。)

  1. Edit and compile the 'Activate' program
    # cd /usr/local/gamess/tools
    # cp actvte.code actvte.f
    # vi actvte.f
    　
    For typical Unix systems, simply replace all cards beginning with '*UNX' in the first 4 columns with 4 blanks. See comments in the file for help and more details.
    　

    # g77 -o actvte.x actvte.f
    ( 切換到 /usr/local/gamess/tools/ 的目錄下，複製 actvte.code 為 actvte.f，並用 vi 編輯 actvte.f。將最前面有 *UNX 的字用空白字元替代，注意，只有在每 "列" 的最前面有" *UNX " 的字用空白字元替代，其它不是在 "列" 的最前面則不用管它。)

  1. Compile GAMESS
    # cd /usr/local/gamess
    # /bin/csh (if not already in csh or tcsh)
    # setenv PATH .:${PATH} (necessary because /bin/comp/may also be in path)
    # compall >& compall.log (takes a while)
    ( 切換到 /usr/local/gamess/ 的目錄下，鍵入 /bin/csh，再輸入 setenv PATH .:${PATH}，再輸入  compall >& compall.log，大概要等個 30~40 min 左右。完成之後，會出現提示字元，再進行下一步。)

  1. Compile ddikick (if a ddi subdirectory exists)
    # cd /usr/local/gamess/ddi
    Update the compddi script # vi compddi
    Edit the following line to read as follows
          set TARGET = linux-pc
    # echo y | compddi >& compddi.log
    # cp -p ddikick.x ../
    ( 切換到 /usr/local/gamess/ddi/ 的目錄下，用 vi 編輯 compddi，將 set TARGET 的路徑改為 set TARGET = linux-pc。接著再輸入 echo y | compddi >& compddi.log，再將 ddikick.x 複製到上一層的目錄中。 )

  1. Compile the g77 IO library patch
    # cd /usr/local/gamess/source
    # tar xzvf /{download_dir}/endfile.tar.gz
    # gcc -c endfile.c
    # cp endfile.o ../object
    ( 切換到 /usr/lcoal/gamess/source 的目錄下，將 endfile.tar.gz 解壓縮至此。接著輸入 gcc -c endfile.c，再將 endfile.o 複製到上一層目錄的 object 的資料夾下。)

  1. Link GAMESS
    # cd /usr/local/gamess
    # lked gamess 00 >& lked.log
    ( 切換到 /usr/local/gamess 的目錄下，輸入 lked gamess 00 >& lked.log。即完成安裝。另外，請檢查在 /usr/local/gamess/目錄下是否有 gamess.00.x 這個檔案，如果沒有，將 gamess.00.x 複製到 /usr/local/gamess/ 的目錄下。最後，請將 gamess 目錄下的群組全部設為 users，避免執行權限的問題發生。如還是執行權限不足，試著把 /usr 及 /usr下的 /local 這兩個目錄的群組設為 users。並且執行的權限設為 755。 )

  1. Test GAMESS
    % cd ~
    % mkdir scr
    % mkdir gamess
    % cp -p /usr/local/gamess/tests/exam01.inp ~/gamess
    % cd ~/gamess
    % /usr/local/gamess/rungms exam01 > exam01.log
    ( 測試 gamess 是否能正常運作，執行完請用 vi 開啟 exam01.log，查看是否有錯誤訊息。並比對 Gamess 提供的使用者手冊上的數據是否相近，通常誤差只有小數點最後兩位。)